Eine rote und eine Grüne Paprika für die Einlage beiseite legen. Die restlichen Paprikaschoten halbieren, entstielen, entkernen, die weißen Seitenwände entfernen, die Schoten waschen, grob zerkleinern und rote und grüne Paprika trennen. Kartoffeln schälen, abspülen, klein schneiden und in 2 Portionen teilen.
Zwiebel abziehen, in Würfel schneiden und zu den roten Paprikastücken geben. Frühlingszwiebeln putzen, waschen und in feine Ringe schneiden und zu den grünen Paprikastücken geben. Liebstöckel abspülen, trocken tupfen und auch zu den grünen Paprikastücken geben.
In zwei Töpfen jeweils die Hälfte der Butter erhitzen. In dem einen Topf Gemüsezutaten und Kartoffeln für die Rote Suppe, in dem anderen Gemüsezutaten und Kartoffeln für die grüne Suppe andünsten.
Rote Paprika mit Paprikapulver und der Hälfte des Mehls bestäuben, die grünen Paprikastücke nur mit der anderen Hälfte des Mehls bestäuben. Beide Gemüse mit jeweils 750 ml Gemüsebrühe und jeweils 150 ml Sahne auffüllen und etwa 40 Minuten unter gelegentlichem Rühren bei schwacher Hitze zugedeckt köcheln lassen.
Rote und grüne Suppe getrennt voneinander pürieren und mit Salz und Pfeffer abschmecken. Zurückgelegte Paprikaschoten in kleine Würfel schneiden und in Salzwasser 5 Minuten kochen.
Zum Servieren zunächst die rote Suppe, dann die grüne Suppe in Teller füllen und beide Suppen mit einer Gabel leicht marmorieren. Zum Schluss mit den Paprikawürfeln garnieren und die Suppe servieren.