Von den Auberginen die Stielansätze entfernen. Die Früchte in Scheiben schneiden. Mit etwas Salz bestreuen. Scheiben in ein Sieb geben. Mit einem Teller, der gerade in das Sieb passt, abdecken und beschweren, um die Flüssigkeit auszupressen. Die Auberginen auf diese Weise ca. 30 Minuten entwässern.
In der Zwischenzeit für die Soße 4 Esslöffel Olivenöl in einer Pfanne erhitzen. Die Zwiebel darin weich und goldbraun braten. Tomaten und Basilikum zugeben, untermischen und alles offen kochen lassen, bis die Mischung zu einer dicken Soße eingekocht ist. Mit Salz und Pfeffer abschmecken.
Auberginenscheiben gründlich mit kaltem Wasser abspülen, um das Salz zu entfernen. Mit Küchenpapier trockentupfen und mit Mehl bestäuben. Etwas von dem restlich Olivenöl in einer großen Pfanne erhitzen. Die Auberginen darin portionsweise braten, bis sie von beiden Seiten gebräunt sind. Nach Bedarf Öl zugießen. Die Scheiben auf Küchenpapier abtropfen lassen.
Auf den Boden einer ofenfesten, gefetteten Form eine Schicht Auberginen legen. Mit Parmesan bestreuen und mit Mozzarellascheiben bedecken. Etwas Tomatensoße drübergießen. Das ganze wiederholen, bis alle Zutaten verbraucht sind. Mit einer Schicht Tomatensoße und Parmesan enden.
Im vorgeheizten Ofen bei 200 Grad ca. 30-40 Minuten backen.