Die Zwiebeln schälen und je nach Größe halbieren oder vierteln.
Das Olivenöl erhitzen und die Zwiebeln mit 4 Stielen Thymian anbraten. Salzen und pfeffern. Mit dem braunen Zucker bestreuen und bei mittlerer Hitze schmelzen lassen.
Den Balsamico und den Rotwein zugießen und aufkochen. Schalotten bei mittlerer Hitze 40-45 Min. offen garen, bis der Rotwein sirupartig eingekocht ist.
Die Zwiebeln heiß in Twist-Off-Gläser füllen und verschließen.