Die Tomaten auf einem Sieb abtropfen lassen und grob zerkleinern. Die Zwiebel und die Knoblauchzehe abziehen und fein würfeln. Öl in einer Pfanne erhitzen und beides darin anschwitzen. Tomaten zugeben und ca. fünf Minuten garen. Basilikum waschen, trocken tupfen und bis auf einige Blättchen in feine Streifen schneiden. Die Hälfte davon unter die Tomatensauce ziehen und mit Salz und Pfeffer abschmecken.

Die Paprikaschote halbieren, putzen, waschen und sehr fein würfeln. Mit Frischkäse, Ei und den restlichen Basilikumstreifen verrühren und mit Salz und Pfeffer abschmecken. Die Käsemasse in einen Spritzbeutel mit runder Tülle füllen und in die Cannelloni spritzen. Die Cannelloni in eine flache, gefettete Auflaufform legen und die Tomatensauce darüber verteilen. Den Mozzarella abtropfen lassen, würfeln und darüber streuen.

Im vorgeheizten Backofen bei 200°C (Gas: Stufe 3) ca. 35 Minuten backen. Mit den beiseitegelegten Basilikumblättchen garniert servieren.