Die Milch vorsichtig erwärmen und den Sahne-Schmelzkäse langsam darin auflösen, dabei öfter mit dem Schneebesen durchrühren. Mit Salz, Pfeffer und Muskat abschmecken und die angerührte Speisestärke unterziehen. Nicht kochen, sonst brennt die Sauce an. Sie bleibt verhältnismäßig dünnflüssig, dickt jedoch während des Backens im Ofen entsprechend an.

Die Zwiebeln schälen, in sehr feine Ringe schneiden und in heißem Olivenöl in einer großen Pfanne goldgelb anbraten. Zwischendurch den Kochschinken in Streifen schneiden. Das Sauerkraut mit Wacholderbeeren, Lorbeerblättern und 1 EL Butter zu den Zwiebeln geben. Mit Salz, Pfeffer, Zucker und Kümmel würzen. Noch ca. 10 Minuten unter ständigem Wenden braten. Dann den Kochschinken und die gekochten und abgetropften Spätzle hinzufügen. Alles gut miteinander vermengen.

Eine große hohe Auflaufform ausbuttern. Eine Schicht von der Spätzlemischung gleichmäßig einfüllen und etwas vom geriebenen Käse darauf verteilen. Dann den Rest der Spätzlemischung hinein geben. Obenauf den Käse streuen und die Käsesauce über den Auflauf gießen.

Im vorgeheizten Backofen bei 190°C Ober-/Unterhitze ca. 45 Min. backen.